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項目介紹

代謝組學可以研究某一生物、組織或細胞在特定環(huán)境下的特定時期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物。相比其他組學，代謝組與表型有著更近的聯(lián)系。蛋白組和代謝組緊密聯(lián)系，蛋白水平會影響代謝產(chǎn)物的表達譜，而代謝物濃度又會影響蛋白表達量。代謝組學分析可以幫助蛋白組數(shù)據(jù)在功能上進行解釋；而蛋白質(zhì)組學分析通過突出參與的酶或酶促途徑，有助于更好地理解代謝組學數(shù)據(jù)。蛋白組學與代謝組學整合分析能夠更好地解釋疾病或外界刺激的分子機理和不同組學對通路的調(diào)控機制，更直觀地了解代謝物、酶及基因之間上下游的調(diào)控關(guān)系。

分析方法

篩選出差異表達的蛋白和代謝小分子，基于O2PLS關(guān)聯(lián)分析進行多變量整合分析。對差異蛋白與差異代謝小分子進行斯皮爾曼（Spearman）相關(guān)性分析，并進一步構(gòu)建相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)。然后，將差異蛋白和差異代謝小分子映射到iPath 整體代謝通路和KEGG 通路上，并進行KEGG 富集分析。最后，利用Cytoscape 中的Metscape 插件進行蛋白組和代謝組的互作網(wǎng)絡(luò)分析。

樣品要求

詳情請聯(lián)系技術(shù)經(jīng)理。

項目案列