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項(xiàng)目介紹

Visium空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是依靠10x Genomics Visium平臺(tái)，結(jié)合顯微成像、靶向探針捕獲、芯片和測(cè)序技術(shù)，從切片中獲取不同位置細(xì)胞中轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，并將組織學(xué)和基因表達(dá)分析結(jié)合，通過數(shù)據(jù)處理進(jìn)行基因表達(dá)和形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)的可視化。

技術(shù)原理

10x Genomics Visium的核心是利用空間表達(dá)芯片捕獲分子并標(biāo)記空間位置和標(biāo)簽，基因表達(dá)芯片包含4個(gè)點(diǎn)陣區(qū)域（6.5mm x 6.5mm），每個(gè)點(diǎn)陣含有4992個(gè)barcoded spot（直徑55um），每一個(gè)spot有一種空間定位條形碼。基因表達(dá)芯片上的組織切片透化后釋放mRNA被spot上對(duì)應(yīng)的條形碼原位捕獲，進(jìn)一步文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序。測(cè)序數(shù)據(jù)中空間條形碼序列將轉(zhuǎn)錄信息映射回組織切片中的起始位置，從而還原轉(zhuǎn)錄本在組織中額位置分布，實(shí)現(xiàn)基因表達(dá)的空間可視化。